MOPS es un compuesto orgánico con fórmula molecular de C ₇ H ₁₅ NO ₄ S y peso molecular de 209.26. MOPS es un tampón biológico importante, que a menudo se usa para preparar un tampón de electroforesis de ARN. No solo se puede usar como un sistema tampón de medio de cultivo celular, sino también como un tampón de electroforesis común y un tampón de cromatografía de purificación de proteínas. La patente CN114317704B presenta un método y kit para detectar N6-metiladenina en moléculas de ácido nucleico. El MOPS en la patente se usa principalmente como un componente tampón, esta semana, el editor de YACOO presentó un método para detectar N6 metiladenina en moléculas de ácido nucleico. Los pasos específicos son los siguientes:

(1) El grupo amino de guanina en la molécula de ácido nucleico que se va a analizar se protege para obtener la molécula de ácido nucleico protegida;

(2) En presencia de compuestos de carbonilo, las moléculas de ácido nucleico protegidas reaccionan con nitrito en un solvente para convertir la adenina en las moléculas de ácido nucleico en hipoxantina. El disolvente es agua, tampón MES, tampón de acetato de sodio, tampón MOPS, tampón PIPES, tampón HEPPS, tampón TRIS o cualquier combinación de los mismos ;

(3) Opcionalmente, desproteger el producto obtenido en el paso (2);

(4) Detectar los productos obtenidos en el paso anterior.

El método de la invención utiliza nitrito para desaminar la adenina en la molécula de ácido nucleico que se va a analizar y convertirla en hipoxantina, mientras que la N6 metil adenina no puede desaminar debido a sus propiedades químicas estables, de modo que la detección del nivel de modificación de m6A o el sitio m6A puede ser realizado analizando la señal de adenina o hipoxantina antes y después de la transformación. Este método tiene una alta sensibilidad y una cuantificación precisa, y puede detectar metiladenina N6 en el genoma completo o en el transcriptoma completo en el nivel de una sola base.

Referencia

CN114317704B Método y kit para la detección de N6-metiladenina en moléculas de ácido nucleico.