método de sds-pagese usa para separar las proteínas antes del análisis por ms. y ejecutando buffers, talescomo glicina o tricina, tendrá un efecto en la separación de proteínasproceso. Los sistemas de búfer de ejecución basados en Tricine se han aplicado con éxito enla separación de varios tipos de proteínas
aunque tricine-dsds-pagees una herramienta poderosa en la separación de proteínas de membrana, williams et al. (doi: 10.1002 / elps.200500730)También exploró otros sistemas de almacenamiento intermedio en conjunción con el enfoque dsds-pagey describir un ortogonal bicine -dsds-page método para el análisis de membranaproteínas de la bacteria anaerobia, clostridiumthermocellum . y compararon los sistemas de glicina, tricina y bicina-dsds-page.
en primer lugar, thermocellum cultivos celulares se cultivaron en55 ° cy cosechado y glycine-, tricine-, y bicine-dsds-page se usaron parasepara las proteínas en la primera dimensión usando el protocolo laemmli, luegomayor separación en la segunda dimensión. debido a geles de sds-page y funcionandolos buffers se operan normalmente en el rango de 6.6-8.8 ph, que hace bicine- (phrango de 7.6-9.0) y sistemas de búfer basados en tricina (rango ph de 7.4-8.8)algo más adecuado. y de acuerdo con los resultados experimentales de la primeradimensión, los parámetros optimizados para la separación de gel en bicine- y tricine-dsds-pagese obtuvieron. basado en los parámetros optimizados obtenidos, experimentos de gran formatose realizaron para mejorar aún más la representación de proteínas y aumentar la proteínacapacidad de carga del gel
en el trabajo de williamset al., encontraron utilizando sistemas de tampones electroforéticos distintos delEl enfoque tradicional Laemmli aumenta la resolución y la representación de la membranaproteínas. y se encontró que bicine-dsds-page proporcionaba la mejor separacióncondición de todos.
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